云南布政使司驻地为云南府。
云南下辖共二十二个府，这些府包含了三十八个散州和二十四个府属县，同时还有五个不辖县的直隶州。
单看府的数量并不多。
但是
明朝一共才有一百六十三个府。
仅云南一省的府数就占了总数量的百分之十三
之所以设置这么多府，原因是当地土官数量太多。
有明一朝，共在云南共设置了三百三十多家土官。
土官又称土司、土酋。
是朝廷赐给当地少数民族首领的职务。
土官主要集职和武职。
武职分别有宣慰使、宣抚使、安抚使和招讨使等；文职则有土知府、土知州、土知县等。
不管是文职土司还是武职土司，都归吏部管理。
朝廷会给予符印证明其官方身份，土司则向朝廷缴纳赋税并承担征发主要是征兵。
除此之外，土官还在其辖区内拥有绝对的统治权力。
简单来说这些土官就是当地的土皇帝。
精明能干且忠诚的土官确实能帮助朝廷治理好地方。
例如马千乘，秦良玉夫妻。
但是如果土官叛乱，将会给朝廷带来非常大的麻烦。文網
如播州之役的杨应龙，奢安之乱的奢崇明和安邦彦。
他们的叛乱不但让当地百姓流离失所，还让大明财政陷入了危机，将大明拖入泥潭。
面对土官的威胁，大明朝廷自永乐时期就开始了改土归流。
改土归流的意思是废除当地土司制度，像内地一样改由朝廷委派流官治理，又称改土官为流官。
永乐十一年，平定贵州思南和思州的叛乱后，朱棣废除了两地的土司制度，改由流官治理。
平定这次叛乱的经过带有一丝传奇色彩。
朱棣为了平定这次叛乱准备了五万大军。
结果根本没用上。
在大军出发的同时数百锦衣卫也从京师出发，先大军一步潜入了思南和思州。
孤军深入的锦衣卫在思州城擒获了思州宣慰使田琛，将其押解进京。
另一伙锦衣卫更厉害。
他们翻山越岭来到思南地区，悄悄摸进思南宣慰司衙门大院，抓获了将正在睡梦中的思南宣慰使田宗鼎。
由于在撤离途中被敌人发现，锦衣卫只能将其活活捅死然后扬长而去。
其后的成化，正德，嘉靖，万历，天启都进行了不同程度的改土归流。
到了崇祯年间。
在内忧外患的困扰下。大明朝廷暂时停止了改土归流，试图用这种方式换取这些地方的安宁。
面对西南土司问题，崇祯试想过先发制人。
但也仅仅停留在试想阶段。
云南的情况比贵州、广西还要复杂。
因为这里不但有错综复杂的少数部落，还与安南越南，老挝，暹罗泰国，缅甸接壤。
如果大明朝只有土司问题，崇祯会毫不犹豫地下令改土归流。
可惜
内部有李自成和张献忠两个大贼作乱，外部有建奴
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